曾用刊名：西南农业大学学报
《西南大学学报》(自然科学版)是教育部主管、西南大学主办的自然科学综合性学术月刊，每月底出版。国内统一连续出版物号为：CN 50-1189/N，国际标准连续出版物号为：ISSN 1673-9868。邮发代号：78-166。
主要栏目有：农业与生命科学、地球与环境科学、数理科学与化学、心理科学、信息科学、工程技术等。
《西南大学学报》(自然科学版)的前身是创刊于1957年的《西南农业大学学报》(自然科学版)，2007年更名为现名。该刊多年来一直以繁荣学术、促进交流、培育人才为宗旨，重视学术创新及学科的前沿性，重视社会效益，以质量求生存、求发展，主要刊载有省部级以上课题基金资助的科研成果，形成了学报服务农业和基础教育的鲜明特色，其各项学术评价指标在综合性科学技术期刊中名列前茅。
《西南大学学报》(自然科学版)是中国精品科技期刊、中国高校百佳科技期刊、重庆市十佳自科期刊、重庆市一级期刊、重庆市重点学术期刊建设工程专项资金资助期刊，4次荣获“百种中国杰出学术期刊”；是中国中文核心期刊、中国科技核心期刊、RCCSE中国核心学术期刊；是中国学术期刊全文数据库（CNKI）、中国科学引文数据库(CSCD)、美国《化学文摘》（CA）、农业文献数据库（AGRICOIA）、万方数字资源系统、维普资讯等的来源期刊。